La filiale di Ponte Tresa si trova al valico doganale sul confine tra il Cantone Ticino e la Lombardia, lungo la direttrice Lugano-Varese. Questo punto di passaggio è utilizzato per il traffico merci della zona del Lago di Lugano e del Malcantone.
Sdoganamento import-export per PMI della regione. Transiti doganali T1/T2. Gestione documentale per merci industriali e beni di consumo. Supporto per spedizioni verso la zona di Varese, Como e Milano ovest.