Le T1 (transit externe) est utilisé pour les marchandises non unionaires traversant le territoire douanier UE/AELE. Le T2 (transit interne) est utilisé pour les marchandises unionaires devant traverser un territoire non-UE (typiquement la Suisse) en conservant leur statut communautaire. Les deux sont gérés via le NCTS et nécessitent une garantie financière. Chaque opération est identifiée par un code MRN unique.